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“HZAU-BioNLP” Lab.
News and stories about our lab in HZAU.
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Latest Lab News.
Forwarded [Engineer position: INFAE]
Bibliome团队目前正在招聘一名自然语言处理方向的全职永久研究工程师。 该职位主要研究应用于生命科学和农业领域大规模知识抽取的自然语言处理方法,工作内容包括使用Transformer模型、大语言模型(LLMs)、知识图谱以及结构化信息提取技术。 可以参考:https://jobs.inrae.fr/concours/concours-externes-ingenieurs-cadres-techniciens-h-f/ir26-mathnum-1
Keep readingForwarded [postdoc position: SUPSI]
南瑞士应用科学与艺术大学(SUPSI)现开放一个博士后研究员全职(100%)岗位。该岗位隶属于创新技术部(DTI),办公地点位于卢加诺的 Dalle Molle 人工智能研究所(IDSIA USI-SUPSI)。https://www.supsi.ch/en/bando26_5003 研究领域为信息检索(Information Retrieval)与自然语言处理(Natural Language Processing),重点研究方向为深度学习及大语言模型架构(Large Language Models Architectures)。 该岗位聘用比例为 100%,合同预计于 2026 年 3 月 1 日或双方协商后的日期开始生效。 How to Apply Interested candidates should submit the following documents: Application Process Applications will only be considered if submitted electronically…
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MaizeLitBase共享任务网页发布
http://lit-evi.hzau.edu.cn/MaizeAlterome/home/ 我们(DeepSeek)谨此介绍一项于2025年下半年在武汉组织的学术活动——“玉米文献知识库(MaizeLitBase)共享任务”。该活动由多国研究人员共同参与,旨在探索通过文本挖掘与知识工程技术,构建面向玉米育种的文献证据知识系统。 1. 活动背景与目的 玉米作为重要的粮食与经济作物,其遗传机制复杂,相关研究文献增长迅速。目前主流的玉米基因组数据库在提供详细的、句子级别的基因-表型关联文献证据方面尚有提升空间。本活动因此尝试构建一个名为MaizeLitBase的专题知识库,旨在对科学文献中的相关实体(如基因、性状)进行识别、规范化,并提取其关联关系,以期将非结构化的文本信息转化为结构化、可关联至标准本体(如GO、TO)的知识,从而为育种研究提供可能的文献证据支持。 2. 主要研究议题 活动聚焦于多个自然语言处理与生物信息学交叉领域的技术探索,包括但不限于: 3. 数据基础 项目构建及研究所基于的数据集具有以下规模: 4. 组织方式与参与情况 活动以多个并行的子课题项目形式开展,目前已列出9个项目,涵盖从数据质量评估、金标准数据集构建到知识图谱搭建及知识产权考量等多个方面。参与者包括来自中国、法国、希腊、瑞士、日本、西班牙等国研究机构的学生与研究人员。活动由来自上述国家相关机构的12位学者组成的程序委员会提供指导。
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皮尔、罗伯特、克蕾尔、安索菲,Merci
谢谢来自French National Research Institute for Sustainable Development (IRD,法国国家可持续发展研究所)的皮尔,以及来自French National Research Institute for Agriculture, Food and Environment (INRAE,法国国家农业食品与环境研究院)的罗伯特、克蕾尔、安索菲。围绕农业文献知识抽取的讨论十分有益。
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Congrats, 本科小朋友研究工作被BIBM2025接收
泽宇为第一作者,留学生Javeed和本科组员刘枭等参与的研究工作《“大脑连接结构阐释和知识蒸馏的图级异常检测”/Graph-level Anomaly Detection of Brain Connectivity with Structure Interpretation and Knowledge Distillation》被BIBM接收。感谢何老师联合指导。 论文摘要: Graph-level anomaly detection is a critical yet underexplored task, especially in the neuro-imaging domain the early identification of abnormal brain patterns is vital. In this paper, we…
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雅文领衔学生团队获“中国大学生5分钟科研英语演讲大赛”全国特等奖
近日,由中国学术英语教学研究会主办的“中国大学生5分钟科研英语演讲大赛”决赛在河南洛阳落幕。经层层选拔和激烈角逐,我院生物信息学专业研究生刘雅文、李庆华、徐鑫鑫、潘虹羽组成的学生团队在指导教师李国亮教授和余隽老师指导下,凭借极具创新性的研究课题“Spy War in the Genome HPV Invasion in 3D Chromatin and Our Counterattack(基因组间谍战:三维染色质视角下的HPV入侵与反制)”斩获全国特等奖。https://coi.hzau.edu.cn/info/1561/52661.htm?_refluxos=a10
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Lab Research Interests
- Corpus design and Biomedical knowledge discovery based on BioNLP (语料库设计和基于BioNLP的知识挖掘)
- Data mining for geno-phenotype association (针对表型-基因型关联的生物信息数据挖掘)
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Cover Story
《每一寸丈量的土地都不会辜负》, Wuhan, Mar 2024.

Riding in East Lake, Wuhan, July 2023.













