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Welcome to Jingbo’s “HZAU-BioNLP” Lab.

News and stories about our lab in HZAU.

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《CIViCmine癌症标志物文本证据自动化挖掘》——GenMed2019论文评述

《CIViCmine》论文评述 文章:《Text-mining clinically relevant cancer biomarkers for curation into the CIViC database》https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6891984/  作者:Jake Lever, Martin R. Jones, Arpad M. Danos, Kilannin Krysiak, Melika Bonakdar, Jasleen K. Grewal, Luka Culibrk, Obi L. Griffith, Malachi Griffith, and Steven J. M. Jones 引用方式:Lever…

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欧阳思卓将主持GDAS Track, CHIP2022评测(“面向“基因-疾病”的关联语义挖掘任务”)报告

基于AGAC语料库的丰富标注数据、针对基因-疾病的关联语义挖掘,围绕NLP算法在生物医药领域的应用,我们于今年暑期组织了GDAS Track,CHIP评测一:“GDAS Track/面向“基因-疾病”的关联语义挖掘任务”。 代表课题组,思卓师姐将于本周日下午参加第八届中国健康信息处理大会的评测论坛,并主持评测一。 本周日(11月27日),成绩最优的前三强队伍被邀请参加评测论坛。演讲题目为: 3:30-4:00 pm评测一:面向“基因-疾病”的关联语义挖掘任务3:30-3:40 pm《基因和疾病的关联机理挖掘:语义网络中的隐式关系推理方法》讲者: 姜逸文队伍:WinHealth-卫宁健康科技股份有限公司3:40-3:50 pm《基于数据增强的小样本疾病基因信息抽取研究》讲者: 苏鑫队伍:Forward-北京交通大学3:30-3:40 pm《面向小样本的医疗领域命名实体识别方法》讲者:任翔渝队伍:深藏blue队-北京理工大学 评测时间:3:30-4:00 pm. 大会直播入口:https://www.withzz.com/live/895402883 GDAS Track, CHIP 2022 评测任务网址: http://lit-evi.hzau.edu.cn/AGAC-CHIP2022/

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《2022秋日常算法Seminar:Learning graph from smooth signals-2016, 2019算法讨论》

👍 《2022秋日常算法Seminar:Learning graph from smooth signals-2016, 2019算法讨论》讨论资料主要对光滑信号学习目标下的图学习模型《How to Learn a Graph from Smooth Signals》和《Large Scale Graph Learning from Smooth Signals》进行模型讲解和算法复盘,参与讨论和资料整理的同学主要包括姚昕智,彭钱钱,贺芷涵,唐子铭。资料21页,主要是黑板推导和当日总结。 (资料下载,请走新手区/秘道。。。)

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《2022秋日常算法Seminar:Bayesian GCN/AAAI-2019算法讨论》

讨论资料主要对Bayesian框架下的GCN图模型《Bayesian graph convolutional neural networks for semi-supervised classification》进行模型讲解和算法复盘,彭钱钱同学领读并持粉笔推演,参与讨论和资料整理的同学包括姚昕智,欧阳思卓,连钰珑,贺芷涵,唐子铭。资料17页,主要是黑板推导和当日总结。 资料预览 资料下载:请走神秘通道。

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《暑期Seminar:期望传播算法 Expectation Propagation》

请从“新手区/秘道”找到讨论资料。 👍《2022暑期Seminar:期望传播算法Expectation Propagation》追加讨论资料,主要是对Minka 2001博士论文《A family of algorithms for approximate Bayesian inference》第三章的解读,参与讨论和资料整理的同学包括姚昕智,欧阳思卓,彭钱钱,贺芷涵,唐子铭。资料56页,主要是黑板推导和当日总结。(File size: 16Mb. Download) Enjoy!

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《暑期Seminar:从图模型到置信传播算法》

请从“新手区/秘道”找到讨论文档。 《2022暑期Seminar:从图模型到BP算法》这套资料主要整理自2022年暑期的黑板讨论和当日的总结,参与讨论和资料整理的同学包括姚昕智,欧阳思卓,彭钱钱,贺芷涵,唐子铭。(File size: 16Mb. Download)

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Cover Story/封面故事

Hiking in Qinglong rock, Wuhan, May 2022. (Click for video)

江夏-青龙山。(点击视频)


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About Jingbo Xia (夏静波)

Ph.D, Associate Professor of Department of Big Data Science, College of Informatics, Hubei key lab of Agricultural Bioinformatics, Huazhong Agricultural University. (More about me. )

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