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“HZAU-BioNLP” Lab.
News and stories about our lab in HZAU.
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Latest Lab News.
皮尔、罗伯特、克蕾尔、安索菲，Merci
谢谢来自French National Research Institute for Sustainable Development (IRD，法国国家可持续发展研究所)的皮尔，以及来自French National Research Institute for Agriculture, Food and Environment (INRAE，法国国家农业食品与环境研究院)的罗伯特、克蕾尔、安索菲。围绕农业文献知识抽取的讨论十分有益。
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Congrats, 本科小朋友研究工作被BIBM2025接收
泽宇为第一作者，留学生Javeed和本科组员刘枭等参与的研究工作《“大脑连接结构阐释和知识蒸馏的图级异常检测”/Graph-level Anomaly Detection of Brain Connectivity with Structure Interpretation and Knowledge Distillation》被BIBM接收。感谢何老师联合指导。 论文摘要： Graph-level anomaly detection is a critical yet underexplored task, especially in the neuro-imaging domain the early identification of abnormal brain patterns is vital. In this paper, we…
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雅文领衔学生团队获“中国大学生5分钟科研英语演讲大赛”全国特等奖
近日，由中国学术英语教学研究会主办的“中国大学生5分钟科研英语演讲大赛”决赛在河南洛阳落幕。经层层选拔和激烈角逐，我院生物信息学专业研究生刘雅文、李庆华、徐鑫鑫、潘虹羽组成的学生团队在指导教师李国亮教授和余隽老师指导下，凭借极具创新性的研究课题“Spy War in the Genome HPV Invasion in 3D Chromatin and Our Counterattack（基因组间谍战：三维染色质视角下的HPV入侵与反制）”斩获全国特等奖。https://coi.hzau.edu.cn/info/1561/52661.htm?_refluxos=a10
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课题组21年起开发的Rice Trait Ontology (v1.0)应邀发布在AgroPortal
访问链接/Link：https://agroportal.lirmm.fr/ontologies/RICE AgroPortal – 农业与生命科学语义共享平台 （内容由DeepSeek生成） AgroPortal 农业与生命科学的语义共享平台 平台简介 AgroPortal 是一个专为农业、食品、营养、植物、生物多样性及相关生命科学领域设计的在线平台。其核心使命是托管、共享和管理各类”本体”与”语义资源”。 简单来说，本体就像是机器能够理解的”高级词典”和”关系网”，它精确地定义了某个领域内的专业术语、概念以及它们之间的复杂关系。在科研数据日益增长的今天，不同研究机构和数据库往往使用不同的数据标准和术语，导致数据之间难以共享和比较，形成”数据孤岛”。 核心功能 AgroPortal 通过提供一系列强大功能来解决数据孤岛难题： 资源中心 集中托管和展示数百个经过注释的语义资源，方便用户查找和重用。 语义标注 研究人员可以利用平台上的标准本体为其数据（如基因序列、作物性状、实验数据）添加准确的语义标签，使数据变得机器可读、可理解。 促进互操作 平台支持将不同本体中的相似概念进行映射关联，从而打破壁垒，实现跨数据库的数据整合与联合分析。 背景与标准 该平台由法国国家农业食品与环境研究院（INRAE）主导开发与维护，并遵循国际万维网联盟（W3C）标准，确保了与国际语义网社区的兼容性。 AgroPortal 是推动农业科学研究数据实现 FAIR原则（可发现、可访问、可互操作、可重用）的关键基础设施，为智慧农业和跨学科研究提供了坚实的数据基石。 AgroPortal: A Semantic Sharing Platform for Agriculture and Life Sciences AgroPortal is an online platform…
Keep reading忆子铭老电影系列
上映时间：2023年7月。 主演：小帅，胡子叔，大强，小强，小美，等。 旁白：这个男人叫小帅，他在一块硕大的黑板边写下了一些公式。从VAE的重参技巧，到一般的PGM模型的实例化过程中的重参化。 旁白：注意看，这个男人刚推完想坐下，就被胡子叔伸手拦住。。。 刚才小帅推导的结论，证明了$z_i=\log_i \pi_i + \varepsilon, \varepsilon follows U(0,1)$的重参过程，恰好能使Catogorial分布的抽样概率最大化，但他使用了“1，2，3，4，5，上山打老虎。” 胡子叔坚持认为要使用k一撇的符号定义，而且想否定小帅的高贵出身，无辜的小帅一脸无辜。可万万没想到，就在下一秒，胡子叔上去动了手。 不要眨眼，继续看，旁边一个男人提出Gumbel分布在重参实现过程中借用均匀分布采样，有利于采到Gumbel偏峰的两侧。原来这个男人是大强，他和小帅是从同一个编队毕业的。
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法兰西的研讨和美食
MalAGE, INRAE 研讨 “还有吃的，土豆烧熟了，再加牛肉。不须放屁！试看天地翻覆。”——《念奴娇，鸟儿问答》 Jouy-en-Josas, 阳台上的举杯
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课题组周泽宇、刘枭等低龄小朋友获得HZAU本科生科技创新专项资助
项目名称：《基于知识蒸馏的图级别异常检测》 恭喜！ 华中农业大学2025年本科生科技创新专项拟立项项目公示 https://tw.hzau.edu.cn/info/1004/7836.htm
Keep reading法国INRAE克蕾尔和罗伯特博士访问课题组，并做学术报告
https://coi.hzau.edu.cn/info/1321/47131.htm （文|何艳红、刘雅文 编辑|辛西 审核|夏静波）4月16日上午，信息学院举办了一场聚焦植物健康智能监测的学术报告会。会议邀请了法国国家农业、食品与环境研究院（INRAE）的Claire Nédellec博士与Robert Bossy博士两位专家，分别围绕《基于EPOP语料库的AI植物疫病预警系统》和《语料库标注质量控制》展开深入学术分享。信息学院副院长章文教授出席会议并致辞，对两位专家的到来表示热烈欢迎，人工智能系夏静波副教授主持学术报告。 Claire Nédellec博士在报告中系统解析了GreenLens智能管道的技术逻辑，并简要介绍了INRAE的组织构成和科研基础。INRAE作为法国国家级的农业、食品与环境研究机构，拥有约10,000名成员，与全球约150个国家的研究者保持合作。Claire博士所在的MaiAGE部门专注于生物信息学、人工智能在农业中的应用，并与DATAIA研究院以及其下属的生物研究小组紧密协作，推动生物医药自然语言处理（BioNLP）技术在农业领域中的深入应用。 GreenLens管道依托自然语言处理技术，从全球5万余份多语言文献中提取植物健康相关实体…
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Lab Members
Lab Research Interests
- Corpus design and Biomedical knowledge discovery based on BioNLP (语料库设计和基于BioNLP的知识挖掘)
- Data mining for geno-phenotype association (针对表型-基因型关联的生物信息数据挖掘)
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Cover Story
《每一寸丈量的土地都不会辜负》, Wuhan, Mar 2024.
Riding in East Lake, Wuhan, July 2023.
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