Welcome to Jingbo’s
“HZAU-BioNLP” Lab.
News and stories about our lab in HZAU.
Today最🔥
Latest Lab News.
MaizeLitBase共享任务网页发布
http://lit-evi.hzau.edu.cn/MaizeAlterome/home/ 我们（DeepSeek）谨此介绍一项于2025年下半年在武汉组织的学术活动——“玉米文献知识库（MaizeLitBase）共享任务”。该活动由多国研究人员共同参与，旨在探索通过文本挖掘与知识工程技术，构建面向玉米育种的文献证据知识系统。 1. 活动背景与目的 玉米作为重要的粮食与经济作物，其遗传机制复杂，相关研究文献增长迅速。目前主流的玉米基因组数据库在提供详细的、句子级别的基因-表型关联文献证据方面尚有提升空间。本活动因此尝试构建一个名为MaizeLitBase的专题知识库，旨在对科学文献中的相关实体（如基因、性状）进行识别、规范化，并提取其关联关系，以期将非结构化的文本信息转化为结构化、可关联至标准本体（如GO、TO）的知识，从而为育种研究提供可能的文献证据支持。 2. 主要研究议题 活动聚焦于多个自然语言处理与生物信息学交叉领域的技术探索，包括但不限于： 3. 数据基础 项目构建及研究所基于的数据集具有以下规模： 4. 组织方式与参与情况 活动以多个并行的子课题项目形式开展，目前已列出9个项目，涵盖从数据质量评估、金标准数据集构建到知识图谱搭建及知识产权考量等多个方面。参与者包括来自中国、法国、希腊、瑞士、日本、西班牙等国研究机构的学生与研究人员。活动由来自上述国家相关机构的12位学者组成的程序委员会提供指导。
Keep reading
皮尔、罗伯特、克蕾尔、安索菲，Merci
谢谢来自French National Research Institute for Sustainable Development (IRD，法国国家可持续发展研究所)的皮尔，以及来自French National Research Institute for Agriculture, Food and Environment (INRAE，法国国家农业食品与环境研究院)的罗伯特、克蕾尔、安索菲。围绕农业文献知识抽取的讨论十分有益。
Keep reading
Congrats, 本科小朋友研究工作被BIBM2025接收
泽宇为第一作者，留学生Javeed和本科组员刘枭等参与的研究工作《“大脑连接结构阐释和知识蒸馏的图级异常检测”/Graph-level Anomaly Detection of Brain Connectivity with Structure Interpretation and Knowledge Distillation》被BIBM接收。感谢何老师联合指导。 论文摘要： Graph-level anomaly detection is a critical yet underexplored task, especially in the neuro-imaging domain the early identification of abnormal brain patterns is vital. In this paper, we…
Keep reading
雅文领衔学生团队获“中国大学生5分钟科研英语演讲大赛”全国特等奖
近日，由中国学术英语教学研究会主办的“中国大学生5分钟科研英语演讲大赛”决赛在河南洛阳落幕。经层层选拔和激烈角逐，我院生物信息学专业研究生刘雅文、李庆华、徐鑫鑫、潘虹羽组成的学生团队在指导教师李国亮教授和余隽老师指导下，凭借极具创新性的研究课题“Spy War in the Genome HPV Invasion in 3D Chromatin and Our Counterattack（基因组间谍战：三维染色质视角下的HPV入侵与反制）”斩获全国特等奖。https://coi.hzau.edu.cn/info/1561/52661.htm?_refluxos=a10
Keep reading
课题组21年起开发的Rice Trait Ontology (v1.0)应邀发布在AgroPortal
访问链接/Link：https://agroportal.lirmm.fr/ontologies/RICE AgroPortal – 农业与生命科学语义共享平台 （内容由DeepSeek生成） AgroPortal 农业与生命科学的语义共享平台 平台简介 AgroPortal 是一个专为农业、食品、营养、植物、生物多样性及相关生命科学领域设计的在线平台。其核心使命是托管、共享和管理各类”本体”与”语义资源”。 简单来说，本体就像是机器能够理解的”高级词典”和”关系网”，它精确地定义了某个领域内的专业术语、概念以及它们之间的复杂关系。在科研数据日益增长的今天，不同研究机构和数据库往往使用不同的数据标准和术语，导致数据之间难以共享和比较，形成”数据孤岛”。 核心功能 AgroPortal 通过提供一系列强大功能来解决数据孤岛难题： 资源中心 集中托管和展示数百个经过注释的语义资源，方便用户查找和重用。 语义标注 研究人员可以利用平台上的标准本体为其数据（如基因序列、作物性状、实验数据）添加准确的语义标签，使数据变得机器可读、可理解。 促进互操作 平台支持将不同本体中的相似概念进行映射关联，从而打破壁垒，实现跨数据库的数据整合与联合分析。 背景与标准 该平台由法国国家农业食品与环境研究院（INRAE）主导开发与维护，并遵循国际万维网联盟（W3C）标准，确保了与国际语义网社区的兼容性。 AgroPortal 是推动农业科学研究数据实现 FAIR原则（可发现、可访问、可互操作、可重用）的关键基础设施，为智慧农业和跨学科研究提供了坚实的数据基石。 AgroPortal: A Semantic Sharing Platform for Agriculture and Life Sciences AgroPortal is an online platform…
Keep reading忆子铭老电影系列
上映时间：2023年7月。 主演：小帅，胡子叔，大强，小强，小美，等。 旁白：这个男人叫小帅，他在一块硕大的黑板边写下了一些公式。从VAE的重参技巧，到一般的PGM模型的实例化过程中的重参化。 旁白：注意看，这个男人刚推完想坐下，就被胡子叔伸手拦住。。。 刚才小帅推导的结论，证明了$z_i=\log_i \pi_i + \varepsilon, \varepsilon follows U(0,1)$的重参过程，恰好能使Catogorial分布的抽样概率最大化，但他使用了“1，2，3，4，5，上山打老虎。” 胡子叔坚持认为要使用k一撇的符号定义，而且想否定小帅的高贵出身，无辜的小帅一脸无辜。可万万没想到，就在下一秒，胡子叔上去动了手。 不要眨眼，继续看，旁边一个男人提出Gumbel分布在重参实现过程中借用均匀分布采样，有利于采到Gumbel偏峰的两侧。原来这个男人是大强，他和小帅是从同一个编队毕业的。
Keep reading
法兰西的研讨和美食
MalAGE, INRAE 研讨 “还有吃的，土豆烧熟了，再加牛肉。不须放屁！试看天地翻覆。”——《念奴娇，鸟儿问答》 Jouy-en-Josas, 阳台上的举杯
Keep reading
Something went wrong. Please refresh the page and/or try again.
Lab Members
Lab Research Interests
- Corpus design and Biomedical knowledge discovery based on BioNLP (语料库设计和基于BioNLP的知识挖掘)
- Data mining for geno-phenotype association (针对表型-基因型关联的生物信息数据挖掘)
Lab Alumni
Who Visited Us
Contact Us >>
To All Projects >>
Cover Story
《每一寸丈量的土地都不会辜负》, Wuhan, Mar 2024.
Riding in East Lake, Wuhan, July 2023.
Jingbo's BioNLP Lab 