Lab news

皮尔、罗伯特、克蕾尔、安索菲,Merci

谢谢来自French National Research Institute for Sustainable Development (IRD,法国国家可持续发展研究所)的皮尔,以及来自French National Research Institute for Agriculture, Food and Environment (INRAE,法国国家农业食品与环境研究院)的罗伯特、克蕾尔、安索菲。围绕农业文献知识抽取的讨论十分有益。

欢迎宇星学姐回实验室游玩

谢谢毕业学姐对师弟师妹的指导。常回来转转,感受青春氛围,迸发艺术风采。 古诗云:“羽扇纶巾,谈笑间,雅思7分常在,樯橹灰飞烟灭。”

Congrats, 本科小朋友研究工作被BIBM2025接收

泽宇为第一作者,留学生Javeed和本科组员刘枭等参与的研究工作《“大脑连接结构阐释和知识蒸馏的图级异常检测”/Graph-level Anomaly Detection of Brain Connectivity with Structure Interpretation and Knowledge Distillation》被BIBM接收。感谢何老师联合指导。 论文摘要: Graph-level anomaly detection is a critical yet underexplored task, especially in the neuro-imaging domain the early identification of abnormal brain patterns is vital. In this paper, we propose KDGAE, a lightweight and generalizable graph autoencoder framework based on knowledge distillation. The architecture…

雅文领衔学生团队获“中国大学生5分钟科研英语演讲大赛”全国特等奖

近日,由中国学术英语教学研究会主办的“中国大学生5分钟科研英语演讲大赛”决赛在河南洛阳落幕。经层层选拔和激烈角逐,我院生物信息学专业研究生刘雅文、李庆华、徐鑫鑫、潘虹羽组成的学生团队在指导教师李国亮教授和余隽老师指导下,凭借极具创新性的研究课题“Spy War in the Genome HPV Invasion in 3D Chromatin and Our Counterattack(基因组间谍战:三维染色质视角下的HPV入侵与反制)”斩获全国特等奖。https://coi.hzau.edu.cn/info/1561/52661.htm?_refluxos=a10

课题组21年起开发的Rice Trait Ontology (v1.0)应邀发布在AgroPortal

访问链接/Link:https://agroportal.lirmm.fr/ontologies/RICE AgroPortal – 农业与生命科学语义共享平台 (内容由DeepSeek生成) AgroPortal 农业与生命科学的语义共享平台 平台简介 AgroPortal 是一个专为农业、食品、营养、植物、生物多样性及相关生命科学领域设计的在线平台。其核心使命是托管、共享和管理各类”本体”与”语义资源”。 简单来说,本体就像是机器能够理解的”高级词典”和”关系网”,它精确地定义了某个领域内的专业术语、概念以及它们之间的复杂关系。在科研数据日益增长的今天,不同研究机构和数据库往往使用不同的数据标准和术语,导致数据之间难以共享和比较,形成”数据孤岛”。 核心功能 AgroPortal 通过提供一系列强大功能来解决数据孤岛难题: 资源中心 集中托管和展示数百个经过注释的语义资源,方便用户查找和重用。 语义标注 研究人员可以利用平台上的标准本体为其数据(如基因序列、作物性状、实验数据)添加准确的语义标签,使数据变得机器可读、可理解。 促进互操作 平台支持将不同本体中的相似概念进行映射关联,从而打破壁垒,实现跨数据库的数据整合与联合分析。 背景与标准 该平台由法国国家农业食品与环境研究院(INRAE)主导开发与维护,并遵循国际万维网联盟(W3C)标准,确保了与国际语义网社区的兼容性。 AgroPortal 是推动农业科学研究数据实现 FAIR原则(可发现、可访问、可互操作、可重用)的关键基础设施,为智慧农业和跨学科研究提供了坚实的数据基石。 AgroPortal: A Semantic Sharing Platform for Agriculture and Life Sciences AgroPortal is an online platform specifically designed for hosting, sharing, and managing ontologies and semantic resources in the domains of…

忆子铭老电影系列

上映时间:2023年7月。 主演:小帅,胡子叔,大强,小强,小美,等。 旁白:这个男人叫小帅,他在一块硕大的黑板边写下了一些公式。从VAE的重参技巧,到一般的PGM模型的实例化过程中的重参化。 旁白:注意看,这个男人刚推完想坐下,就被胡子叔伸手拦住。。。 刚才小帅推导的结论,证明了$z_i=\log_i \pi_i + \varepsilon, \varepsilon follows U(0,1)$的重参过程,恰好能使Catogorial分布的抽样概率最大化,但他使用了“1,2,3,4,5,上山打老虎。” 胡子叔坚持认为要使用k一撇的符号定义,而且想否定小帅的高贵出身,无辜的小帅一脸无辜。可万万没想到,就在下一秒,胡子叔上去动了手。 不要眨眼,继续看,旁边一个男人提出Gumbel分布在重参实现过程中借用均匀分布采样,有利于采到Gumbel偏峰的两侧。原来这个男人是大强,他和小帅是从同一个编队毕业的。

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